La Copa Ecuador confirmó oficialmente el fixture de los dieciseisavos de final del torneo. Estos serán los cruces programados para esta fase del certamen nacional:
- FC Insutec vs Barcelona SC — 12 de mayo | 15h00
- Baños Ciudad de Fuego vs Delfín SC — 12 de mayo | 18h00
- Astillero FC vs Guayaquil City — 14 de mayo | 15h00
- Liga de Portoviejo vs Libertad FC — 19 de mayo | 18h00
- Daquilema FC vs Emelec — 20 de mayo | 15h30
- San Antonio vs Aucas — 21 de mayo | 14h00
- 9 de Octubre vs Manta FC — 22 de mayo | 15h00
- Vinotinto FC vs Orense SC — 27 de mayo | 15h30
- El Nacional vs Universidad Católica — 28 de mayo | 18h00
- Juventus Italiana vs Técnico Universitario — 29 de mayo | 15h30
- Huaquillas FC vs Leones del Norte — 29 de mayo | 18h30
- CD La Unión vs Deportivo Cuenca — 2 de junio | 15h30
- Gualaceo SC vs Mushuc Runa — 3 de junio | 15h30
- Cuenca JRS vs Macará — 4 de junio | 18h30
- Independiente Juniors vs Liga de Quito — fecha por confirmar
- Santo Domingo vs Independiente del Valle — fecha por confirmar